Od wersji 3.0 WordPress daje bardzo elastyczny sposób tworzenia menu za pomocą funkcji wp_nav_menu. Więcej na ten temat możesz przeczytać np. tutaj:
http://justintadlock.com/archives/2010/06/01/goodbye-headaches-hello-menus
Jeśli jednak korzystasz z jakiegoś gotowego motywu, to być może działa on jeszcze w oparciu o starą wersję wyświetlania menu, tj. wp_list_pages.
Pierwsze co musisz zrobić, to przejrzeć pliki header.php i sidebar.php i sprawdzić, za pomocą której z tych wymienionych wyżej funkcji budowane jest menu u Ciebie.